L’histoire nous entraîne dans le quotidien de Toru Acura, un soldat de 20 ans à la retraite depuis la fin de la guerre, qui vit avec sa sœur adoptive. Un jour, Toru fait la rencontre de Chaika, une mystérieuse fille qui porte un énorme cercueil sur son dos. Dès lors, la vie du jeune homme prend un tout autre tournant…

Después de la formación del nuevo mundo y de la derrota de Evolto, Sento Kiryu y Ryuga Banjo se pueden ver en una instalación de almacenamiento registrando la última historia que recuerdan. . Sento señala que no podían pedir ayuda por voz a aquellas personas que existían en este mundo porque todos sus recuerdos relacionados con la Caja de Pandora fueron borrados, incluidos ellos dos. Al necesitar dinero para quedarse donde están, Sento ha estado creando varios inventos para que Ryuga los venda, el último de los cuales fue un elemento de transformación que podría superar al Dragón Cross-Z.Después de que Ryuga se va, un extraterrestre llamado Killbus emerge del panel blanco de Pandora y copia los recuerdos y la apariencia de Sento. Killbus dice que Evolto le robó la caja de Pandora y que quiere recuperarla.

"¡El plan de aniquilación de Build! Lanzado por el nuevo Primer Ministro de Touto, consiste en, como su nombre implica, cazar a Kamen Rider Build y ejecutarlo. Banjo, que ahora está del lado del gobierno, le robará el Hazard Trigger y se lo dará al Primer Ministro para que este se convierta en Kamen Rider Blood... ¿Por qué está Banjo del lado del gobierno? ¿Qué quiere Kamen Rider Blood realmente? ¿Cuál es el secreto del Best Match Rabbit/Dragon? ¡La película iluminará los misterios del nacimiento de Build!"

Lupin recibe un enorme diamante llamado Crepúsculo (amanecer en el doblaje latino) de parte del viejo Dolune, el jefe del Sindicato Europeo de Crimen Organizado. El diamante es en realidad la llave para acceder a un tesoro abandonado por el clan Gelt hace un siglo. Lupin viaja a Marruecos, donde supuestamente se encuentra el tesoro, pero resulta que hay dos Crepúsculos, y sin ambos, la puerta hacia el tesoro no se abrirá. Se dice que la otra parte de la llave está en poder del hijo de Dolune, pero no se sabe quién es ni dónde está. Al mismo tiempo, otro grupo está buscando el tesoro, unos asesinos contratados por los descendientes del clan Gelt. Una gran pelea se desata y naturalmente, Lupin queda atrapado en el medio de ella.

Kaitou Kid envía una advertencia a Miss Judie diciendo que quiere robarle su preciado anillo. Judie le pide ayuda a Kogoro Mouri y cuando él, Ran, Sonoko, Conan, Ai, Agasa y los Jóvenes Detectives van a visitarla al teatro coinciden con el inspector Nakamori, quien no no viene solo: ¡Shinichi le acompaña! Conan sabe que Shinichi es Kaitou Kid disfrazado, pero nada puede hacer al respecto. Después, todos abordan un avión y vuelan a Sapporo. Judie los invita para agradecerles por proteger el anillo. Judie visita a los pilotos, y cuando vuelve cae muerta. Ha sido envenenada. De repente, los pilotos también han sido envenenados, así que tienen que aterrizar el avión ellos mismos. Y Kid parece estar también entre los pasajeros ¿Podrá Conan atrapar a Kid y salvarlos de estrellarse?